Nakato laboratory

東京大学定量生命科学研究所大規模生命情報解析研究分野
（新領域創成科学研究科メディカル情報生命専攻生物機能情報分野）
中戸研究室

■ 学生募集

当研究室では、次世代シーケンサ（NGS）を用いたゲノム・エピゲノム研究に興味のある学生を募集しています。当研究室には新領域創成科学研究科メディカルゲノム専攻、または医学研究科分子細胞生物学専攻から入学可能です。見学随時受け付けていますのでお気軽にご連絡ください。

■ NEWS

2023

2023.1.27

2022年度創発的研究支援事業に採択されました。課題名「大規模ゲノム解析の新たな価値を拓く情報解析基盤の創出」

2022
2022.12.13

2022年度公益財団法人アステラス病態代謝研究会研究助成に採択されました。課題名「先天性遺伝子疾患の機序解明のための時系列ゲノム解析」
2022.11.30-12.2

第45回日本分子生物学会年会(MBSJ2022, 千葉)にてワークショップ「統合型ゲノム解析で挑むゲノム立体構造の意義解明」を開催し、中戸が口頭発表を行いました。

同じくMBSJ2022で技術職員の西條さんが口頭発表を行いました。また、助教のNagaiさん、博士課程の王さん、大庭さんがポスター発表を行いました。
2022.10.31

2022年度住友財団基礎科学研究助成に採択されました。課題名「新規の重要遺伝子探索のための符号付きネットワークを用いたシングルセル解析」
2022.9.27

博士課程の王さんの論文が Nucleic Acids Research誌にアクセプトされました。Title: "CohesinDB: a comprehensive database for decoding cohesin-related epigenomes, 3D genomes and transcriptomes in human cells"　プレスリリース
2022.9.13-15

第11回生命医薬情報学連合大会 (IIBMP2022, 大阪)にてワークショップ「大規模NGSデータを基盤としたゲノム解析」を開催し、Leeさんが口頭発表を行いました。

同じくIIBMP2022で王さんが口頭発表（ハイライトトラック）、Nagaiさんがポスター発表を行いました。
2022.7.1

中戸が准教授に昇任しました。
2022.6.29

技術職員の西條さんが2022年度（第60回）三島海雲記念財団学術研究奨励金に採択されました。課題名「コリン添加食による肝疾患改善メカニズムの解明」
2022.6.9

博士課程の王さんの論文が Nature Communications誌にアクセプトされました。Title: "Large-scale multi-omics analysis suggests specific roles for intragenic cohesin in transcriptional regulation"　プレスリリース
2022.4.1

特任研究員の長岡さんと修士課程の周さんが新しく加わりました。

特任研究員のNagaiさんが助教に昇任しました。

2021
2021.12.1

博士課程の王さんの論文が Briefing in Bioinformatics誌にアクセプトされました。Title: "HiC1Dmetrics: framework to extract various one-dimensional features from chromosome structure data"　プレスリリース
2021.12.1-3

第44回日本分子生物学会年会（MBSJ2021, 横浜）で西條さんが口頭発表（ワークショップ）、Nagaiさん、王さん、大庭さん、山田さんがポスター発表を行いました。
2021.10.1

特任助教のLeeさんと研究生の任さんが新しく加わりました。
2021.9.27-29

第10回生命医薬情報学連合大会 (IIBMP2021, オンライン)にて仲嶋さんが口頭発表、大庭さんがポスター発表を行いました。
2021.7.22

特任研究員の仲嶋さんの論文が Nucleic Acids Research誌にアクセプトされました。Title: "Codependency and mutual exclusivity for gene community detection from sparse single-cell transcriptome data"　プレスリリース
2021.4.1

秘書の古賀さんが新しく参加しました。
2021.1.13

2020年度iPSアカデミアジャパン研究助成に採択されました。課題名「希少疾患由来 iPS 細胞を用いた細胞分化系譜破綻の機序解明のための１細胞解析系の確立」
2021.1.4

Nagai博士が特任研究員として新しく参加しました。

2020
2020.12.2-4

第43回日本分子生物学会年会でワークショップ「シングルセル解析と異分野融合アプローチによる細胞社会ダイバーシティーの理解」を開催しました。また、当研究室の仲嶋さんが口頭発表、西條さん、王さん、堺谷さんがポスター発表を行いました。
2020.9.29

AMED-PRIME「早期ライフステージ」に採択されました。課題名「頑健なデータ駆動形エピゲノム解析を実現する情報解析システムの構築」
2020.9.4

第2回 ASHBi数理生物研究集会 (京都大学)にて講演しました。（オンライン）
2020.9.3
第9回生命医薬情報学連合大会 (IIBMP2020)にて口頭発表しました。（オンライン）
2020.8.21

論文が Computational and Structural Biotechnology Journal誌にアクセプトされました。Title: "Toward understanding the dynamic state of 3D genome"
2020.3.30

論文が Methods誌にアクセプトされました。Title: "Methods for ChIP-seq analysis: A practical workflow and advanced applications"
2020.2.12-13

KKRホテル熱海にて新学術「細胞ダイバース」第三回若手ワークショップを主催しました。→詳細
2020.3.15-19

博士課程の王さんが Keystone Symposia "Higher-Order Chromatin Architecture in Time and Space"にてポスター発表を行います →新型コロナウイルスの影響で学会が中止となりました。
2020.1.29

新学術領域「細胞社会ダイバース」第五回公開シンポジウムにて口頭発表を行いました。

2019
2019.12.19

論文がEpigenetics & Chromatin誌にアクセプトされました。Title: "Comprehensive epigenome characterization reveals diverse transcriptional regulation across human vascular endothelial cells"　プレスリリース
2019.12.3-6

第42回日本分子生物学会年会でワークショップを開催しました。演題名「細胞社会ダイバーシティーの統合的解明と制御に挑む１細胞・１分子計測の数理科学」
2019.10.10

生物物理研究会「理論と実験」2019にて口頭発表を行いました。
2019.10.2-4

新学術「細胞ダイバース」後援による1細胞解析技術講習会を主催しました。→詳細
2019.9.25

RNAフロンティアミーティング2019にて講演を行いました。
2019.9.19

第４回定量生命科学研究所シンポジウムにて口頭発表を行いました。
2019.6.26

第13回国際ゲノム会議で口頭発表(ショートトーク)を行いました。

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