Nakato laboratory

東京大学定量生命科学研究所大規模生命情報解析研究分野
（新領域創成科学研究科メディカル情報生命専攻生物機能情報分野）
中戸研究室

■ マルチNGSオミクス解析研究会のお知らせ

AMED-PRIME「頑健なデータ駆動形エピゲノム解析を実現する情報解析システムの構築」での取り組みの一貫として開催していた「マルチNGSオミクス解析研究会」は2022年3月分をもって終了しました。多くのご参加ありがとうございました。

■ 学生募集

当研究室では、次世代シーケンサ（NGS）を用いたゲノム・エピゲノム研究に興味のある学生を募集しています。当研究室には新領域創成科学研究科メディカルゲノム専攻、または医学研究科分子細胞生物学専攻から入学可能です。見学随時受け付けていますのでお気軽にご連絡ください。

■ NEWS

2022

2022.7.1

中戸が准教授に昇任しました。
2022.6.9

博士課程の王さんの論文が論文が Nature Communications誌にアクセプトされました。Title: "Large-scale multi-omics analysis suggests specific roles for intragenic cohesin in transcriptional regulation"　プレスリリース
2022.4.1

特任研究員の長岡さんと修士課程の周さんが新しく加わりました。

特任研究員のNagaiさんが助教に昇任しました。

2021
2021.12.1

博士課程の王さんの論文が Briefing in Bioinformatics誌にアクセプトされました。Title: "HiC1Dmetrics: framework to extract various one-dimensional features from chromosome structure data"　プレスリリース
2021.12.1-3

第44回日本分子生物学会年会（MBSJ2021, 横浜）で西條さんが口頭発表（ワークショップ）、Nagaiさん、王さん、大庭さん、山田さんがポスター発表を行いました。
2021.10.1

特任助教のLeeさんと研究生の任さんが新しく加わりました。
2021.9.27-29

第10回生命医薬情報学連合大会 (IIBMP2021, オンライン)にて仲嶋さんが口頭発表、大庭さんがポスター発表を行いました。
2021.7.22

特任研究員の仲嶋さんの論文が Nucleic Acids Research誌にアクセプトされました。Title: "Codependency and mutual exclusivity for gene community detection from sparse single-cell transcriptome data"　プレスリリース
2021.4.1

秘書の古賀さんが新しく参加しました。
2021.1.13

2020年度iPSアカデミアジャパン研究助成に採択されました。課題名「希少疾患由来 iPS 細胞を用いた細胞分化系譜破綻の機序解明のための１細胞解析系の確立」
2021.1.4

Nagai博士が特任研究員として新しく参加しました。

2020
2020.12.2-4

第43回日本分子生物学会年会でワークショップ「シングルセル解析と異分野融合アプローチによる細胞社会ダイバーシティーの理解」を開催しました。また、当研究室の仲嶋さんが口頭発表、西條さん、王さん、堺谷さんがポスター発表を行いました。
2020.9.29

AMED-PRIME「早期ライフステージ」に採択されました。課題名「頑健なデータ駆動形エピゲノム解析を実現する情報解析システムの構築」
2020.9.4

第2回 ASHBi数理生物研究集会 (京都大学)にて講演しました。（オンライン）
2020.9.3
第9回生命医薬情報学連合大会 (IIBMP2020)にて口頭発表しました。（オンライン）
2020.8.21

論文が Computational and Structural Biotechnology Journal誌にアクセプトされました。Title: "Toward understanding the dynamic state of 3D genome"
2020.3.30

論文が Methods誌にアクセプトされました。Title: "Methods for ChIP-seq analysis: A practical workflow and advanced applications"
2020.2.12-13

KKRホテル熱海にて新学術「細胞ダイバース」第三回若手ワークショップを主催しました。→詳細
2020.3.15-19

博士課程の王さんが Keystone Symposia "Higher-Order Chromatin Architecture in Time and Space"にてポスター発表を行います →新型コロナウイルスの影響で学会が中止となりました。
2020.1.29

新学術領域「細胞社会ダイバース」第五回公開シンポジウムにて口頭発表を行いました。

2019
2019.12.19

論文がEpigenetics & Chromatin誌にアクセプトされました。Title: "Comprehensive epigenome characterization reveals diverse transcriptional regulation across human vascular endothelial cells"　プレスリリース
2019.12.3-6

第42回日本分子生物学会年会でワークショップを開催しました。演題名「細胞社会ダイバーシティーの統合的解明と制御に挑む１細胞・１分子計測の数理科学」
2019.10.10

生物物理研究会「理論と実験」2019にて口頭発表を行いました。
2019.10.2-4

新学術「細胞ダイバース」後援による1細胞解析技術講習会を主催しました。→詳細
2019.9.25

RNAフロンティアミーティング2019にて講演を行いました。
2019.9.19

第４回定量生命科学研究所シンポジウムにて口頭発表を行いました。
2019.6.26

第13回国際ゲノム会議で口頭発表(ショートトーク)を行いました。

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